Movable Type 3.2をインストールしました。

Movable Type 3.17をインストールしたときと同じで、パスに % が含まれているためソースコードを編集する必要がありました。

lib/MT.pm の 542行目を

if ($plugin !~ /^([-\\/\@\:\w.\s~\%]+)$/);

に変更して、動作するようになりました。